医院设有名医苑、脑病（神志病）科、内分泌（糖尿病）科、脾胃病科、心血管病科、呼吸内科、肿瘤科、肾病科、综合内科、普通外科、泌尿外科、肿瘤外科、乳腺/甲状腺/血管外科、微创外科、骨伤科、肛肠科、妇产科、儿科、新生儿科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、皮肤科、美容中医科、男科、康复科、急诊科、重症医学科、膏方门诊、保健科、麻醉科、医学检验科、超声科、医学影像科、消化内镜室、心电图室、支气管镜室、肺功能室、药学部等临床科室和医技科室。
一、国家中医药管理局“十二五”重点专科培育项目：神志病科。
二、福建省中医重点专科：妇科、糖尿病科。
三、福建省中医重点专科建设项目：肛肠科、脾胃病科、儿科。
四、福州市中医重点专科：呼吸内科、康复科、中医预防保健科、中医眼科。
五、福州市中医重点专病：腰椎间盘突出专病、高血压专病、骨质疏松症专病。
六、福州市中医重点专科建设项目：骨科护理专科。
一、优势病种：神经炎、脑卒中、帕金森病、偏瘫、头痛、坐骨神经痛、头晕、记忆减退、失眠、焦虑症、不孕不育病、月经病、盆腔炎性疾病、先兆流产、异位妊娠、阴道炎、痛经、妊娠期高血压病、妊娠期糖尿病、妊娠浮肿、羊水过多、糖尿病、糖尿病肾病、甲状腺疾病、痛风、骨质疏松、肛周脓肿、肛瘘、肛周炎、肛周湿疹、直肠脱垂、直肠炎、结肠炎、肛窦炎、萎缩性胃炎及癌前病变、消化道出血、溃疡性结肠炎、肠易激综合症、肠结核、非病毒性肝病如脂肪肝、肝纤维化、肝硬化、急慢性胆囊炎、急慢性胰腺炎、颈椎病、腰椎间盘突出症、肩周炎、劳损及骨质增生类疾病、慢性阻塞性肺疾病、支气管哮喘、睡眠呼吸暂停低通气综合征、肺炎、肺心病、肺癌、间质性肺病、冠心病、心律失常、心力衰竭、干眼症、过敏性结膜炎、白内障、青光眼、眼底出血性疾病。
二、优势技术：针刺疗法、艾灸疗法、敷脐疗法、穴位敷贴、埋线疗法、中药外敷、耳穴疗法、宫腹腔镜微创手术诊疗、子宫疤痕憩室阴式修补术、盆底功能障碍性微创修复、经阴道子宫肌瘤剔除术、子宫切除术、子宫次全切除术、中药保留灌肠、旷置留桥术治疗复杂性肛瘘、高位挂线低位切开引流缝合术治疗高位复杂性肛瘘、中药直肠滴入、中药消化道内镜介入、穴位注射、白内障超声乳化摘除联合人工晶状体植入术、抗青光眼术、翼状胬肉切除加干细胞移植术、内翻倒睫矫正术、中药眼部雾化。
